از موارد توافق رژیم با آژانس بین‌المللی انرژی اتمی، یکی مورد چاشنی کلاهک های اتمی است که نوعی از موشک ها می‌تواند آنرا حمل کند. موافقت با شفاف سازی در این مورد و دادن اجازه تحقیق به آژانس در این باره، همان موافقتی است که سال ها رژیم تن به آن نمی داد. وجود این چاشنی و یا سعی در ساختن آن، دلالت می کند بر وجود برنامه اتمی نظامی. بنابراین، یا باید بر آژانس ثابت شود چنین چاشنی وجود نداشته و رژیم بنابر ساختنش نداشته و یا باید ثابت شود از زمانی ببعد، اجرای برنامه اتمی نظامی را رها کرده است. اما
همزمان با گفتگوهای ظریف با آشتون در وین، سپاه دست به آزمایش موشک دوربرد زد. این شد که وندی شرمن، خواستار گنجانده شدن موشکهای بالستیک ایران در دستور گفتگوهای کشورهای 5+1 با ایران شد. هرچند، سرانجام قرار براین شد که موشکها در دستورکار قرار نگیرند، اما وندی شرمن، از لزوم گفتگو در باره این موشکها و حقوق بشر سخن گفت.
و در 27 فوریه 2014 رویترز از قول یک منبع بی‌نام، گزارش کرد که آژانس بین‌المللی انرژی اتمی از انتشار گزارشی درباره ایران، چشم پوشیده‌است که اتهامهای جدیدی را دربردارد. این گزارش را آژانس در سال گذشته تهیه کرده‌است. آژانس بدین‌خاطر گزارش را انتشار نداده‌است که هم موجب خشم ایران می‌شود و هم گفتگوهای 5+1 با ایران را می‌کشد.
دانسته نیست که مفاد گزارش چیست. الا اینکه موارد توافق آژانس با ایران هم آنهاهستند که در این گزارش آمده اند. ایران پذیرفته است در باره تکنولوژی دو منظوره و چاشنی اتمی به آژانس اطلاعات مورد تقاضا را بدهد.
با آنکه مقامات امریکا به ایران فشار می آورند با آژانس همکاری بیشتری بکند، پیتر جنکینس، سفیر سابق انگلستان در آژانس، بر این نظر است که گزارش های جدید آژانس حاکی از آنند که ایران با آژانس همکاری کامل می کند. و مسائلی که باید حل شوند، مسائل مربوط به گذشته هستند.
در 28 فوریه، آژانس بین‌المللی انرژی اتمی، گزارش رویترز را تکذیب کرد: چنین گزارشی هرگز وجود نداشته است. این تکذیبیه بعد از آن منتشر شد که اسرائیل از آژانس خواست گزارش را منتشر کند.
انقلاب اسلامی در هجرت شماره ۴۸۹ از ۱۹ اسفند ۱۳۹۲ تا ۳ فروردین ۱۳۹۳